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Reino Fungi, Clasificación Taxonómica por Cavalier-Smith (1999): nueve reinos en dos dominios

Árbol filogenético de Cavalier-Smith (1999): nueve reinos en dos dominios. Todos los seres vivos comparten su origen: todos provienen del reino móneras. Este reino abarca los seres unicelulares procariotas, que carecen de núcleo celular. Son las arqueobacterias y las eubacterias.   De los móneras surgieron los protoctistas. Este reino reúne seres eucariotas unicelulares heterótrofos y con digestión interna (protozoos), y eucariotas unicelulares o pluricelulares sin tejidos, autótrofos fotosintéticos (algas).   El reino de los hongos comprende seres eucariotas, unicelulares o pluricelulares, sin tejidos, heterótrofos y con digestión externa. Las metáfitas o plantas son eucariotas pluricelulares con tejidos y nutrición autótrofa. En 1998, Cavalier-Smith propuso un nuevo sistema de clasificación con dos suprareinos ( Prokariota  y  Eukaryota ) y seis reinos: Bacterias, Protozoos, Chromistas, Hongos, Plantas y Animales.

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